More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6737 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 327 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 333 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  55.65 
 
 		 331 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  54.95 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  55.65 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  55.24 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  54.95 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 333 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  52.63 
 
 		 330 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 345 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  53.4 
 
 		 331 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 348 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  51.89 
 
 		 329 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 354 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 333 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  51.33 
 
 		 355 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 363 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 329 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 353 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 333 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 356 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 356 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 348 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 372 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 309 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 372 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  46.59 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  39.13 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 1201 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  38.04 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  38.39 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  33.67 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 316 aa  72  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  32.77 
 
 		 369 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  32.77 
 
 		 369 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 346 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 346 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 346 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 343 aa  72  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  34.86 
 
 		 374 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  34.95 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  33.07 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1355  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  33.03 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  42.47 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>