More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6275 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 330 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  74.31 
 
 		 327 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  74.31 
 
 		 327 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  74.06 
 
 		 356 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  56.48 
 
 		 331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  53.4 
 
 		 331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  54.93 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 333 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 331 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  44.94 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  43.91 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  40.84 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 330 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 348 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 332 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 316 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 348 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  54.08 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 360 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.62 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  27.92 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 387 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  28.35 
 
 		 345 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.27 
 
 		 344 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.27 
 
 		 344 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 338 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  27.69 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  27.87 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  26.03 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 322 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 346 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  26.9 
 
 		 374 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 346 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 346 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  26.27 
 
 		 369 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 		 369 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 325 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  25.84 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  25.68 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  37.06 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  25.17 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  33.99 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  32.87 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  26.75 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  30.65 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  33.1 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  23.78 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>