More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2476 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  680    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  66.57 
 
 		 327 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  65.87 
 
 		 330 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  59.88 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  54.41 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  53.8 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  44.48 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  46.43 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  44.66 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  46.49 
 
 		 330 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  44.51 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 329 aa  245  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 327 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 354 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 348 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  36.2 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 372 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 372 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 360 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  27.69 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  27.11 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 319 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 321 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.06 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  28.31 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 362 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 387 aa  93.2  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  26.22 
 
 		 358 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  26.01 
 
 		 361 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 317 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 325 aa  89.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  27.9 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  28.48 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.9 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  26.93 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.9 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  28.93 
 
 		 374 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 		 316 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  26.96 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  25.76 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  23.29 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  27.19 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  25.83 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>