More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3868 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 330 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  96.65 
 
 		 327 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  65.87 
 
 		 333 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 333 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  51.98 
 
 		 331 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  50.91 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  42.02 
 
 		 329 aa  245  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  44.26 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  40.06 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  42.17 
 
 		 356 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 354 aa  215  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 349 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 353 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 360 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.44 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 319 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  29.54 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 334 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 387 aa  86.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  28.75 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  26.98 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  22.71 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  32.88 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  27.41 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  25.47 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  29.79 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  24.09 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  34.21 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4365  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  26.22 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4584  transcriptional activator FtrA  29.75 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  28.62 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>