More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4584 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4584  transcriptional activator FtrA  100 
 
 		 323 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  54.81 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  52.9 
 
 		 320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  39.81 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1996  transcriptional regulator  45.08 
 
 		 346 aa  225  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  39.68 
 
 		 326 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  41.12 
 
 		 346 aa  225  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  40.89 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  43.99 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  40.66 
 
 		 334 aa  215  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  42.52 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 		 321 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  41.01 
 
 		 333 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 350 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.3 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 342 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  37.42 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  36.7 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  38.41 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  38.41 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  38.41 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  38.41 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  38.41 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  40.95 
 
 		 323 aa  205  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  39.37 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  38.1 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  37.46 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  38.1 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  36.14 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 349 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  37.62 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  38.41 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  39.57 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  37.78 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  37.78 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  39.1 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 335 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  38.1 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 335 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  37.54 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  35.37 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  43.88 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  37.58 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 335 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  38.59 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  41.33 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  37.58 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  37.46 
 
 		 321 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 340 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  38.73 
 
 		 356 aa  195  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  42.46 
 
 		 313 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  35.02 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  39.94 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  38.19 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  36.62 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  38.8 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  35.9 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  38.94 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  41.01 
 
 		 350 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  35.78 
 
 		 321 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  38.72 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  41.12 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6996  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  39.65 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  39.65 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  37.46 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3331  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  37.03 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  41.58 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  32.8 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>