More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6996 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6996  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 338 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  44.52 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  43.12 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  51.1 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  43.81 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  41.69 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  46.84 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  47.7 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  42.77 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  44.83 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  44.33 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  40.92 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  48.47 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  43.67 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  40.7 
 
 		 346 aa  202  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  39.3 
 
 		 322 aa  202  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  47.89 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  40.12 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  43.85 
 
 		 327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  42.86 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  43.9 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.69 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4584  transcriptional activator FtrA  40.13 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 342 aa  195  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  38.15 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2855  AraC family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 349 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  44.19 
 
 		 306 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  45.13 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  44.77 
 
 		 324 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  41.37 
 
 		 317 aa  189  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  39.48 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  37.85 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  40.56 
 
 		 317 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  44.37 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  41.36 
 
 		 320 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  41.36 
 
 		 320 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  41.36 
 
 		 320 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4043  transcriptional regulator, AraC family  42.01 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  43.91 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 335 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  41.01 
 
 		 321 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  45.7 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  37.94 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  41.59 
 
 		 321 aa  182  9.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  40.51 
 
 		 320 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  43.32 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0092  AraC family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  43.32 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  43.32 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  43.32 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1996  transcriptional regulator  41.9 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  40.29 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  37.39 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  40.43 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  41.37 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  42.96 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  37.38 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  39.57 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  42.01 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  38.34 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  38.34 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  40.21 
 
 		 328 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  38.34 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  38.34 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 326 aa  175  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  40.65 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  38.34 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>