More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6224 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 367 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  66.52 
 
 		 332 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  67.7 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  64.89 
 
 		 330 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  64.63 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  61.5 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  63.93 
 
 		 352 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  62.95 
 
 		 332 aa  279  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  61.82 
 
 		 327 aa  276  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  65.52 
 
 		 327 aa  271  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  66.97 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2855  AraC family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 258 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  58.18 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  55.95 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  52.36 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  52.36 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  53.92 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  56.74 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  53.7 
 
 		 326 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 333 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 325 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  52.97 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 326 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  49.15 
 
 		 306 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  51.82 
 
 		 321 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  54.38 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  50.92 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  52.09 
 
 		 329 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  49.13 
 
 		 362 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  49.35 
 
 		 320 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  50.21 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  50.45 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  50.23 
 
 		 324 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 342 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 316 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  55.09 
 
 		 319 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  49.59 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 330 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  49.54 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  50.46 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  50.44 
 
 		 328 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  53.39 
 
 		 356 aa  212  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 350 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  47.16 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  50 
 
 		 318 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  50 
 
 		 318 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  50 
 
 		 318 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  50 
 
 		 318 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  51.61 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  50 
 
 		 318 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  49.77 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  44.25 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  50 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  49.77 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  52.09 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  48.62 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  49.77 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  49.32 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  49.08 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  49.77 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  49.54 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  50.23 
 
 		 313 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  49.31 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  49.09 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  49.31 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  49.31 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  49.55 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 341 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 341 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  44.25 
 
 		 317 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  48.87 
 
 		 315 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  48.62 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  48.02 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  48.62 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  49.53 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 315 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 315 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  48.61 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  46.35 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 320 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  47.91 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  48.15 
 
 		 321 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  49.07 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>