More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2855 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2855  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  65.85 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 367 aa  265  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  62.81 
 
 		 330 aa  262  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  64.65 
 
 		 328 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 332 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  62.69 
 
 		 322 aa  240  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  58.05 
 
 		 327 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  58.59 
 
 		 327 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  62.12 
 
 		 352 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  58.08 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  52.88 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  56.28 
 
 		 321 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  52.4 
 
 		 326 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  52.4 
 
 		 326 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  54.77 
 
 		 318 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  56.57 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 314 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 325 aa  224  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  61.39 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  56.78 
 
 		 321 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  52.53 
 
 		 306 aa  218  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 340 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  54.04 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 356 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 333 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 331 aa  211  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 342 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  53.77 
 
 		 348 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 318 aa  208  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  52.53 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  52.26 
 
 		 338 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.02 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  48.99 
 
 		 321 aa  198  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 350 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  45.96 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 341 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 341 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 333 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  50.51 
 
 		 329 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  49.25 
 
 		 320 aa  194  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  51.76 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  50.75 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  49.76 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  53.03 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  48.28 
 
 		 333 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  48.48 
 
 		 334 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  55.78 
 
 		 325 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 315 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  49.75 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 349 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  45.96 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  49.75 
 
 		 328 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  47.98 
 
 		 326 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  48.24 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  52.26 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  48.99 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 335 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  46.86 
 
 		 335 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 335 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  47.26 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 335 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  50.99 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  47.57 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  49.49 
 
 		 317 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  49.75 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  49.75 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  49 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 315 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6996  transcriptional regulator, AraC family  51.52 
 
 		 338 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  49.25 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  47.74 
 
 		 350 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  45.96 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  49.01 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  48 
 
 		 346 aa  181  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  45.73 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  44.72 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  48.99 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  52.48 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  44.1 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 331 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  44.22 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 333 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  44 
 
 		 333 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  46.23 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  44 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>