More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3737 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 314 aa  222  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  36.88 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 331 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  35.65 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  35.95 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 329 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 333 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 363 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 309 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 251 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 360 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  24.61 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  43.16 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  22.06 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  23.91 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  22.98 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  33.11 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  23.8 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 278 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  25.48 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  24.19 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3906  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.67 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  24.77 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 546 aa  69.3  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  24.1 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.2 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 538 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>