More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1793 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1793  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 445 aa  907    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2316  AraC family transcriptional regulator  62.43 
 
 		 380 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0587517  normal  0.0445967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3765  AraC family transcriptional regulator  57.85 
 
 		 385 aa  463  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0713818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0156  AraC family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 386 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0774  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.87 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2801  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.41 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.749326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0800  transcriptional regulator, AraC family  37.77 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6583  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4330  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3906  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.97 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3940  xylose operon regulatory protein  30.93 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.688005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4045  xylose operon regulatory protein  30.93 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.654241  normal  0.387961 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3985  xylose operon regulatory protein  30.93 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3876  xylose operon regulatory protein  30.93 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3859  xylose operon regulatory protein  30.93 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1869  helix-turn-helix domain-containing protein  29.82 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.713108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03421  DNA-binding transcriptional activator, xylose-binding  30.13 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.684991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0141  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0145  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3953  xylose operon regulatory protein  30.13 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3772  xylose operon regulatory protein  30.13 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3892  xylose operon regulatory protein  30.13 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3724  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 390 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4945  xylose operon regulatory protein  30.13 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.028978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03372  hypothetical protein  30.13 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4065  xylose operon regulatory protein  30.13 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0152  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 392 aa  176  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4432  transcriptional regulator, AraC family  29.72 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4151  transcriptional regulator, AraC family  29.72 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4155  xylose operon regulatory protein  28.61 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.664411  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4098  xylose operon regulatory protein  28.61 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0060  AraC family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0102  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0794  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0064  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0082  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 395 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.719713  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3035  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.65 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2304  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 391 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0753369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3229  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3001  xylose operon regluatory protein  29.95 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2882  helix-turn-helix, AraC type:periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.53 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677365  normal  0.592102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2343  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6634  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.903716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4073  transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 		 407 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4185  transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 		 407 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2623  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4206  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6330  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6507  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6741  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15092  normal  0.533175 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6031  AraC family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2337  xylose operon regluatory protein  26.29 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247833  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6331  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  28.08 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  30.19 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  26.64 
 
 		 328 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  31.06 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  31.06 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1847  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  31.68 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  31.06 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  31.06 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1769  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  29.28 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  31.06 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  24.27 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  31.06 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.76 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  31.06 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  30.27 
 
 		 338 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  30.43 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6940  LacI family transcription regulator  27.43 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634122  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  30.43 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1151  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.42 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.848461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  25.96 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2244  LacI family transcription regulator  31.22 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2252  LacI family transcription regulator  32.12 
 
 		 346 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305473 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.53 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  22.71 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2461  LacI family transcription regulator  29.63 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2345  alanine racemase  29.63 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  24.23 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1479  LacI family transcription regulator  27.7 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.04 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  28.8 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 214 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  29.78 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.36 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  27.59 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 1201 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0392  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0318668 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  23.11 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  28.16 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1131  regulatory protein, LacI  29.17 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  34.34 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>