More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2316 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2316  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 380 aa  790    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0587517  normal  0.0445967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3765  AraC family transcriptional regulator  65.24 
 
 		 385 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0713818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0156  AraC family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 386 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1793  AraC family transcriptional regulator  62.43 
 
 		 445 aa  490  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0774  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.48 
 
 		 384 aa  322  9.000000000000001e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2801  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.89 
 
 		 386 aa  268  8.999999999999999e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.749326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0800  transcriptional regulator, AraC family  34.89 
 
 		 401 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6583  transcriptional regulator, AraC family  31.84 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3906  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.24 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4330  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3876  xylose operon regulatory protein  32.62 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3724  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4045  xylose operon regulatory protein  32.62 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.654241  normal  0.387961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3859  xylose operon regulatory protein  32.62 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3985  xylose operon regulatory protein  32.62 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3940  xylose operon regulatory protein  32.62 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.688005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0152  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 392 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3229  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  0.0104866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03421  DNA-binding transcriptional activator, xylose-binding  31.2 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.684991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0141  transcriptional regulator, AraC family  31.2 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3892  xylose operon regulatory protein  31.2 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3953  xylose operon regulatory protein  31.2 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4065  xylose operon regulatory protein  31.2 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4945  xylose operon regulatory protein  31.2 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.028978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03372  hypothetical protein  31.2 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0145  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3772  xylose operon regulatory protein  31.2 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1869  helix-turn-helix domain-containing protein  30.4 
 
 		 393 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.713108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0102  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4151  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 		 392 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0794  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4432  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3035  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.53 
 
 		 380 aa  159  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0064  transcriptional regulator, AraC family  30.24 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2304  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0753369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2343  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0060  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4155  xylose operon regulatory protein  30.1 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.664411  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4098  xylose operon regulatory protein  30.1 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2882  helix-turn-helix, AraC type:periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.18 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677365  normal  0.592102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0082  transcriptional regulator, AraC family  30.42 
 
 		 395 aa  149  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.719713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3001  xylose operon regluatory protein  32.08 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282498  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4073  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 		 407 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4185  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 		 407 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6634  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.903716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2337  xylose operon regluatory protein  31.3 
 
 		 397 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247833  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4206  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 397 aa  142  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2623  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242365 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6330  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6507  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 397 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6331  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 397 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6741  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 397 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15092  normal  0.533175 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6031  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  28.14 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0366  transcriptional regulator, LacI family  31.71 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  33.01 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3298  LacI family transcription regulator  31.89 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  27.9 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.46 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  32.8 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  31.71 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  26.62 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  31.05 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  30.89 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  30.89 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  30.89 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  30.89 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  30.89 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  32.35 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  27.47 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  35.8 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  27.85 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  31.84 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  28.15 
 
 		 332 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  28.29 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3623  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0382  transcriptional regulator, LacI family  31.84 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.32 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  35.8 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.8 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  35.8 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  35.8 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  29.36 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  35.8 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  35.8 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  35.8 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2073  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000787477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  31.1 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  35.19 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  25.86 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  31.65 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  35.19 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  29.89 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.57 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  32.31 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  26.25 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.61 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>