More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0794 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0794  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 387 aa  808    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0102  AraC family transcriptional regulator  61.68 
 
 		 392 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4151  transcriptional regulator, AraC family  61.62 
 
 		 392 aa  484  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0064  transcriptional regulator, AraC family  61.1 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4432  transcriptional regulator, AraC family  61.36 
 
 		 392 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0152  AraC family transcriptional regulator  60.21 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03421  DNA-binding transcriptional activator, xylose-binding  60.37 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.684991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0141  transcriptional regulator, AraC family  60.37 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3772  xylose operon regulatory protein  60.37 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0082  transcriptional regulator, AraC family  60.16 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.719713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03372  hypothetical protein  60.37 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4155  xylose operon regulatory protein  60.21 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.664411  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4098  xylose operon regulatory protein  60.21 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4945  xylose operon regulatory protein  60.37 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.028978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3953  xylose operon regulatory protein  60.37 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0060  AraC family transcriptional regulator  60.21 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3892  xylose operon regulatory protein  60.37 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0145  AraC family transcriptional regulator  60.37 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4065  xylose operon regulatory protein  60.37 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4045  xylose operon regulatory protein  59.84 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.654241  normal  0.387961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3859  xylose operon regulatory protein  59.84 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3876  xylose operon regulatory protein  59.84 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3940  xylose operon regulatory protein  59.84 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.688005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3985  xylose operon regulatory protein  59.84 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1869  helix-turn-helix domain-containing protein  52.62 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.713108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3724  AraC family transcriptional regulator  52.62 
 
 		 390 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4073  transcriptional regulator, AraC family  47.41 
 
 		 407 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4185  transcriptional regulator, AraC family  47.41 
 
 		 407 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2343  AraC family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6330  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 397 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6507  AraC family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6741  AraC family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15092  normal  0.533175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4206  AraC family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6331  AraC family transcriptional regulator  48.56 
 
 		 397 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2337  xylose operon regluatory protein  46.86 
 
 		 397 aa  358  7e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247833  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6634  transcriptional regulator, AraC family  46.65 
 
 		 405 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.903716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2623  AraC family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 405 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242365 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6031  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3001  xylose operon regluatory protein  45.6 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2882  helix-turn-helix, AraC type:periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.85 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677365  normal  0.592102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2304  AraC family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 391 aa  345  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0753369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0774  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.38 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2801  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.81 
 
 		 386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.749326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0800  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3765  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0713818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0156  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 386 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2316  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 380 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0587517  normal  0.0445967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1793  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 445 aa  156  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3035  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.13 
 
 		 380 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4330  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 386 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3906  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.26 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6583  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3229  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 411 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  28.88 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.68 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  26.21 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  26.34 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  26.34 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  25.89 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  25.89 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  25.89 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  25.89 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  25.89 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  25.89 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  25.89 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  25.89 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4766  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.38 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  25.85 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  25.19 
 
 		 718 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  26.21 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  27.27 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  26.32 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2073  transcriptional regulator, LacI family  29.73 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000787477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  29.76 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  28.08 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.9 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  24.59 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1007  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  29.37 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  28.04 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  35 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3483  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 296 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  24.18 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  26.34 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  25.37 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  25.14 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6821  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1911  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2824  transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.60964 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 277 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4014  Alanine racemase  25.51 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.251479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>