More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3483 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3483  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 296 aa  614  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3607  transcriptional regulator, AraC family  85.36 
 
 		 284 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0501  transcriptional regulator, AraC family  79.64 
 
 		 284 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0422  transcriptional regulator, AraC family  77.82 
 
 		 284 aa  434  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3841  transcriptional activator RhaR  52.48 
 
 		 290 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0738  transcriptional activator RhaR  53.28 
 
 		 290 aa  288  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0386443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3753  transcriptional activator RhaR  53.65 
 
 		 290 aa  288  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.890732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4263  transcriptional activator RhaR  48.34 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4078  transcriptional regulator, AraC family  47.43 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5360  transcriptional activator RhaR  47.43 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4136  transcriptional activator RhaR  47.43 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4111  transcriptional activator RhaR  47.43 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03792  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  47.43 
 
 		 312 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03741  hypothetical protein  47.43 
 
 		 312 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4332  transcriptional activator RhaR  48.34 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0206667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4292  transcriptional activator RhaR  48.34 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4378  transcriptional activator RhaR  47.97 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4299  transcriptional activator RhaR  47.06 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4444  transcriptional activator RhaR  47.97 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4439  transcriptional activator RhaR  47.06 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4386  transcriptional activator RhaR  46.69 
 
 		 312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.815414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4065  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 282 aa  251  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4384  transcriptional activator RhaS  37.27 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4297  transcriptional activator RhaS  36.9 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082999 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4437  transcriptional activator RhaS  36.9 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03791  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  36.9 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4079  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03740  hypothetical protein  36.9 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4112  transcriptional activator RhaS  36.9 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5358  transcriptional activator RhaS  36.9 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4135  transcriptional activator RhaS  36.9 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4291  transcriptional activator RhaS  36.3 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4377  transcriptional activator RhaS  36.3 
 
 		 278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4331  transcriptional activator RhaS  36.3 
 
 		 278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0197402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4443  transcriptional activator RhaS  35.93 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4262  transcriptional activator RhaS  35.93 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4066  transcriptional activator RhaS  34.81 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.828841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0500  transcriptional activator RhaS  34.18 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3484  transcriptional activator RhaS  33.7 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0421  transcriptional activator RhaS  33.45 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3608  transcriptional activator RhaS  32.72 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0740  transcriptional activator RhaS  31.02 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0791489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3754  transcriptional activator RhaS  31.02 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3842  transcriptional activator RhaS  31.02 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02292  predicted DNA-binding protein  35.4 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1172  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.324704  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02253  hypothetical protein  35.4 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3614  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.950607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2672  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1287  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1275  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2519  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  26.12 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2751  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  25.63 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  33.68 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  33.66 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1007  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  34.55 
 
 		 1374 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2534  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  27.42 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  33.87 
 
 		 1376 aa  69.7  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  35.58 
 
 		 1355 aa  69.7  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 513 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  25.07 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  34.48 
 
 		 1340 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  22.7 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  33.68 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1661  putative regulatory protein  31.25 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0701683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1796  putative regulatory protein  31.25 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.259376 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  33.04 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  33.33 
 
 		 1400 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  29.46 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2050  AraC family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1480  putative regulatory protein  31.25 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1794  putative regulatory protein  31.25 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227844  normal  0.117823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>