More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1770 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 320 aa  670    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  40.65 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0304  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0706  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 		 330 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0374737  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 313 aa  125  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0626  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 330 aa  125  9e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653952  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  23.28 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  28.66 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  27.92 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  27.34 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  26.75 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  26.75 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3954  helix-turn-helix domain-containing protein  30.63 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  32.87 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  21.99 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.27 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  29.07 
 
 		 1201 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  31.36 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  31.01 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  31.36 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.51 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1451  transcriptional regulator, AraC family protein  27.39 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0743909  normal  0.362871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  30.51 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  27.39 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4321  helix-turn-helix domain-containing protein  23.68 
 
 		 357 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.92 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1988  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  hitchhiker  0.00402915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5369  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.92 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01665  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.16 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.46 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01654  hypothetical protein  25.16 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1486  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.012343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1935  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.46 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.46 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1946  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.192766  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1899  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2412  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.46 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.46 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.46 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  26.46 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  27.08 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.46 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  31.3 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1500  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.831009  normal  0.0187399 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1912  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  25.47 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  30.5 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 760 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>