More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0626 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0626  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 330 aa  681    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653952  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0706  transcriptional regulator, AraC family  87.58 
 
 		 330 aa  607  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0374737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  28.93 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  25.26 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  28 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  21.65 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.3 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0074  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  30.66 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 773 aa  62.8  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3035  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.32 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  26.88 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  28.82 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  24.79 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  22.16 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  22.87 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  22.11 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  25.18 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1299  transcriptional regulator, AraC family  26.24 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  27.88 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06729  hypothetical protein  23.03 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3954  helix-turn-helix domain-containing protein  43.06 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  23.78 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0304  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  27.27 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00477  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 365 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000822  transcriptional regulator AraC family  26.27 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.184938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0385  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 766 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  21.88 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4385  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.357896  decreased coverage  0.000854827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0021  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.68 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.67 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000320877  normal  0.335599 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3125  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000947593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 530 aa  56.2  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  26.24 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.77 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.37 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 440 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.55 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.55 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.55 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.55 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4771  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  27.45 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>