More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0526 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0526  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1163  AraC-type transcriptional regulator domain protein  57.61 
 
 		 300 aa  315  5e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000040891  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1284  AraC family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 297 aa  285  4e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.960401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  39.7 
 
 		 312 aa  199  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  38.2 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  37.59 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  35.34 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  35.66 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 320 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2814  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00480171  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3775  AraC-like transcriptional regulator  34.29 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1698  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3330  AraC-like transcriptional regulator  33.69 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  36.25 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2498  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467728  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3237  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0968  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5449  AraC family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2739  transcriptional regulator, AraC family  34.89 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2755  transcriptional regulator, AraC family  35.97 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877904 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3531  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4835  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108272 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  31.38 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1153  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0923  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1008  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351707  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2251  AraC family transcription regulator  35.38 
 
 		 390 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0088  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90451  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1528  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.836546  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3397  transcriptional regulator, AraC family  37.2 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1453  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 299 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0109  AraC-like transcriptional regulator  32.38 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  hitchhiker  0.00915457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4732  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583037  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4209  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2598  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0694  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  39.51 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3052  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7736  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2599  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2399  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0625  transcription regulator protein  40.41 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2712  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.974943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  37.25 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0877  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 298 aa  158  8e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000157744  decreased coverage  0.000000000198967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0736  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 303 aa  158  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0723  AraC-like transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2981  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3074  transcriptional regulator, AraC family  32.75 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.618991  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0723  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.065718 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  31.14 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4307  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2236  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5491  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2576  AraC-like transcriptional regulator  32.3 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.289552 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6605  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0589608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2474  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3720  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44403  normal  0.422333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3546  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  32.93 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32460  transciption regulator, AraC-family  34.82 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6678  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41036  normal  0.11497 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2948  transcriptional regulator, AraC family  35.1 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0708341 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5835  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6202  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 373 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2598  transcription regulator protein  34.84 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 312 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1947  AraC-like transcriptional regulator  34.48 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>