More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2598 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2598  transcription regulator protein  100 
 
 		 299 aa  597  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0807  transcriptional regulator, AraC family  74.58 
 
 		 299 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344416  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3072  transcriptional regulator, AraC family  74.92 
 
 		 299 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0709507  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  46.48 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3720  transcriptional regulator, AraC family  44.29 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44403  normal  0.422333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4483  AraC-like transcriptional regulator  44.18 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000135378 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  44.41 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2399  AraC family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 323 aa  235  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0109  AraC-like transcriptional regulator  40.75 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  hitchhiker  0.00915457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  44.32 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3330  AraC-like transcriptional regulator  40.41 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 314 aa  227  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3546  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  40.88 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 303 aa  221  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  40 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  42.09 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32460  transciption regulator, AraC-family  44.44 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  43.54 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3543  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  40.96 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0733434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 302 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  41.7 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 320 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0407  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  41.7 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0694  transcriptional regulator, AraC family  42.7 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0810  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.542883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2576  AraC-like transcriptional regulator  42.86 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.289552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1153  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 325 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1008  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 325 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351707  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1528  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 325 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.836546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0923  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139126  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0088  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90451  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2251  AraC family transcription regulator  43.12 
 
 		 390 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 338 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  40.22 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 313 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 338 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 329 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 338 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2814  transcriptional regulator, AraC family  40.81 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00480171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2755  transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 		 302 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877904 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5491  transcriptional regulator, AraC family  40.56 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  40.73 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7736  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  40.07 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 306 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2591  transcriptional regulator transcription regulator protein  39.22 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3721  AraC family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0850692  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4647  AraC family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0736  transcriptional regulator, AraC family  42.35 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2611  AraC family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2598  transcriptional regulator, AraC family  41.24 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2498  transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467728  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5657  AraC family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3775  AraC-like transcriptional regulator  38.55 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2739  transcriptional regulator, AraC family  37.68 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4209  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4732  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583037  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0723  AraC-like transcriptional regulator  40.94 
 
 		 303 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2738  AraC-type transcriptional regulator domain protein  38.6 
 
 		 330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5449  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0723  AraC family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.065718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1698  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3531  AraC family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4835  AraC family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108272 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7135  AraC family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3606  AraC-like transcriptional regulator  40.44 
 
 		 295 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3397  transcriptional regulator, AraC family  43.25 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7439  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0968  transcriptional regulator, AraC family  36.92 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2474  AraC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  43.43 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  35.44 
 
 		 321 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2948  transcriptional regulator, AraC family  37.41 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0708341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2599  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0625  transcription regulator protein  40.38 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4219  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.767301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2981  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4307  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1947  AraC-like transcriptional regulator  40.16 
 
 		 303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3214  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1453  AraC family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0877  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000157744  decreased coverage  0.000000000198967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>