More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2236 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2236  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
272 aa  553  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  51.14 
 
 
312 aa  296  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6678  AraC family transcriptional regulator  55.97 
 
 
373 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41036  normal  0.11497 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6202  AraC family transcriptional regulator  55.6 
 
 
373 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724324 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6605  AraC family transcriptional regulator  55.22 
 
 
354 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0589608  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5835  AraC family transcriptional regulator  55.6 
 
 
326 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2799  AraC family transcriptional regulator  50.94 
 
 
365 aa  277  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  47.31 
 
 
302 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  46.54 
 
 
302 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 
310 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  47.51 
 
 
312 aa  244  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  49.04 
 
 
307 aa  244  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  45.38 
 
 
302 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  46.62 
 
 
329 aa  244  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  46.64 
 
 
303 aa  241  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  45.56 
 
 
312 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 
320 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  45.19 
 
 
314 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  49.6 
 
 
320 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  45.85 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  47.64 
 
 
320 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  46.27 
 
 
315 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2755  transcriptional regulator, AraC family  46.07 
 
 
302 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.877904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 
306 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
309 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2498  transcriptional regulator, AraC family  46.07 
 
 
302 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467728  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  45.9 
 
 
310 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  41.44 
 
 
305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  44.62 
 
 
306 aa  222  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  47.76 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0088  AraC family transcriptional regulator  46.18 
 
 
327 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0923  AraC family transcriptional regulator  46.18 
 
 
327 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1153  AraC family transcriptional regulator  46.18 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2251  AraC family transcription regulator  46.75 
 
 
390 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  43.37 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1528  AraC family transcriptional regulator  46.18 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.836546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1008  AraC family transcriptional regulator  46.18 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351707  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3531  AraC family transcriptional regulator  48.19 
 
 
307 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4835  AraC family transcriptional regulator  48.19 
 
 
307 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108272 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5449  AraC family transcriptional regulator  48.19 
 
 
307 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0109166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  43.51 
 
 
302 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  45.21 
 
 
314 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3606  AraC-like transcriptional regulator  46.36 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2576  AraC-like transcriptional regulator  43.94 
 
 
313 aa  215  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.289552 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3330  AraC-like transcriptional regulator  43.92 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  41.63 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  46.01 
 
 
306 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  46.01 
 
 
306 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  40.75 
 
 
313 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  43.98 
 
 
321 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
338 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
338 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
338 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2738  AraC-type transcriptional regulator domain protein  47.04 
 
 
330 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  45.25 
 
 
306 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4732  AraC family transcriptional regulator  46.12 
 
 
308 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583037  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4307  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
302 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4209  AraC family transcriptional regulator  45.74 
 
 
308 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378308  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7736  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
338 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  41.8 
 
 
307 aa  208  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5491  transcriptional regulator, AraC family  45.7 
 
 
320 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  42.69 
 
 
303 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  40.38 
 
 
300 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4483  AraC-like transcriptional regulator  41.7 
 
 
336 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000135378 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0109  AraC-like transcriptional regulator  41.18 
 
 
299 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  hitchhiker  0.00915457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2739  transcriptional regulator, AraC family  44.49 
 
 
307 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2611  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
299 aa  201  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0694  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0625  transcription regulator protein  42.96 
 
 
321 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2283  transcriptional regulator, AraC family  43.66 
 
 
307 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0736  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  42.32 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2712  AraC family transcriptional regulator  45.04 
 
 
299 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.974943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2814  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00480171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1698  AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 
302 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0723  AraC-like transcriptional regulator  41.79 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2599  AraC family transcriptional regulator  41.73 
 
 
315 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0877  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
298 aa  194  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000157744  decreased coverage  0.000000000198967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 
313 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  41.15 
 
 
284 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2598  transcriptional regulator, AraC family  41.9 
 
 
320 aa  191  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  38.4 
 
 
299 aa  191  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2474  AraC family transcriptional regulator  45.2 
 
 
310 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446232  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0968  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
302 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3721  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 
299 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0850692  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 
299 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4647  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 
299 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5657  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 
299 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0723  AraC family transcriptional regulator  45.97 
 
 
331 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.065718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2981  AraC family transcriptional regulator  41.37 
 
 
321 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2399  AraC family transcriptional regulator  39.68 
 
 
323 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4219  AraC family transcriptional regulator  40.3 
 
 
302 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.767301  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3397  transcriptional regulator, AraC family  43.25 
 
 
311 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3546  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  36.74 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3237  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 
322 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1453  AraC family transcriptional regulator  40.49 
 
 
299 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3052  AraC family transcriptional regulator  41.39 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7439  transcriptional regulator, AraC family  40.84 
 
 
291 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>