More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0100 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0100  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1147  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 311 aa  171  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4771  transcriptional regulator, AraC family  26.51 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  26.51 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  26.39 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.17 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000320877  normal  0.335599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 397 aa  68.9  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2546  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  31.25 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 365 aa  65.5  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 309 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001306  putative ARAC-type regulatory protein  36.84 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  27.46 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.63 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  32.63 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3978  transcriptional regulator, AraC family  25.78 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250001  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  32.99 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2509  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00177278  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05185  hypothetical protein  35.79 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6783  transcriptional regulator, AraC family  31.55 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  31.52 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 532 aa  62.4  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.7 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06729  hypothetical protein  28.89 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  24.55 
 
 		 301 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0879  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 299 aa  62  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000031891  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  32.61 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 544 aa  62  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 303 aa  62  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0893  putative HTH-type regulatory protein, AraC family  31.68 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.364356  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.79 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  38.2 
 
 		 1296 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05000  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  25.87 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.989106  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  25.87 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0279  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  32.32 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1419  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  30.25 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  28.04 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3755  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051726  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  30.61 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1161  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000709496  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  29 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3586  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.15 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  26.67 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1988  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  hitchhiker  0.00402915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4652  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2262  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1451  transcriptional regulator, AraC family protein  32.69 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0743909  normal  0.362871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  32.69 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  24.6 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 513 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1795  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>