More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0590 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  100 
 
 		 347 aa  709    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2118  HTH-type transcriptional regulator  72.96 
 
 		 328 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  72.93 
 
 		 331 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2953  helix-turn-helix domain-containing protein  63.89 
 
 		 349 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0872  AraC family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 382 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  45.05 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 462 aa  278  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  43.93 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  43.93 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  42.6 
 
 		 393 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 360 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 357 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.64 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  42.28 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  44.3 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 357 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  41.91 
 
 		 387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  42.06 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 350 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 361 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 338 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7250  transcriptional regulator AraC family  44.97 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  38.49 
 
 		 363 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1392  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.683187  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_004310  BR0307  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 338 aa  208  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.96292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0400  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0321  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.5557  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3514  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3159  AraC family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3921  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 327 aa  189  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.441659  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2210  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3564  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  34.08 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2357  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 332 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2481  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4575  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0814  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 345 aa  169  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6285  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.716439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  30.15 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 375 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  30.46 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  30.15 
 
 		 367 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1788  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 353 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3767  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3056  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 344 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.351096  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2064  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3665  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 401 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  normal  0.253179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 368 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  29.71 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  29.34 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2234  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 349 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>