More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0872 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0872  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 382 aa  766    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2118  HTH-type transcriptional regulator  52.47 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  51.05 
 
 		 347 aa  319  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  51.66 
 
 		 331 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2953  helix-turn-helix domain-containing protein  48.56 
 
 		 349 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  46.4 
 
 		 360 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 361 aa  295  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 351 aa  295  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  45.82 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 462 aa  289  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  45.7 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 410 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  45.87 
 
 		 393 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  45.7 
 
 		 396 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  45.15 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 357 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 355 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 357 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  44.54 
 
 		 360 aa  279  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  44.65 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  42.35 
 
 		 337 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  41.76 
 
 		 337 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7250  transcriptional regulator AraC family  41.25 
 
 		 332 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 363 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1392  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.683187  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  35.15 
 
 		 351 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3514  transcriptional regulator  37.12 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3159  AraC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0400  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2210  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0307  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.96292  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4575  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2357  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 332 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0321  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 336 aa  189  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.5557  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3564  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2481  AraC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  37.46 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 332 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0814  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 343 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  35.69 
 
 		 332 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6285  AraC family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 337 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.716439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 325 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3767  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3921  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 327 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.441659  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  33.73 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 344 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  30.06 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 331 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  29.14 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 331 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5693  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  30.41 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 339 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  32.63 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1937  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 367 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 332 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 367 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>