More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3767 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3767  transcriptional regulator  100 
 
 		 371 aa  757    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 321 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 368 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 332 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 332 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 332 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 332 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 332 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 332 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  35.31 
 
 		 375 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 331 aa  210  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1937  transcriptional regulator, AraC family  39.67 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 339 aa  206  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 367 aa  205  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 343 aa  205  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  34.82 
 
 		 343 aa  205  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  36.09 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  35.87 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 364 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  35.76 
 
 		 367 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1655  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.33 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 344 aa  201  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 338 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  34.29 
 
 		 337 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  33.55 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 332 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 332 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1576  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 332 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 325 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 339 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 332 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  33.13 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 314 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  33.44 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6285  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.716439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5693  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 314 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 314 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 314 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34510  ArgR-like transcriptional regulator, AraC family  34.14 
 
 		 324 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 361 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1831  transcriptional regulator ArgR  35.45 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  30.31 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 317 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3566  helix-turn-helix, AraC type  34.7 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  34.87 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  33.22 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4621  transcriptional regulator ArgR  34.36 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 361 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52740  transcriptional regulator ArgR  34.36 
 
 		 329 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 314 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 314 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 314 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1528  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 335 aa  176  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.755279  normal  0.310325 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 314 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4482  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 326 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1433  helix-turn-helix domain-containing protein  39.56 
 
 		 326 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.392956  normal  0.582162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3771  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 326 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128178  normal  0.013148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>