More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12970 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  100 
 
 		 306 aa  629  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0325  transcriptional regulator, AraC family  42.39 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  31.39 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  26.21 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4771  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  33.59 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  37.37 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2321  transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.612609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  31.54 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.1 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  32.33 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  26.47 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2973  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 127 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3978  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0866  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0100  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  30.21 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  34.74 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0650  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2509  AraC family transcriptional regulator  19.07 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00177278  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  35.35 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6783  transcriptional regulator, AraC family  30.5 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  23.13 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.88 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  30.61 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.52 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  30.11 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0072  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  31.06 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  32.03 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0422  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  29.75 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>