More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1747 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 337 aa  679    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 337 aa  679    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 377 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 377 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  32.88 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0072  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3086  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2540  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 259 aa  92.4  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  30.27 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  39.6 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 234 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  32.94 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  33.74 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  29.24 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  40.96 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 313 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 313 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  39.76 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  39.76 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  31.71 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  39.76 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.04 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 544 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0392  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35070  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.03 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.81 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  20.37 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3125  transcriptional regulator, AraC family  23.42 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000947593  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  29.27 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  31.33 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  24.46 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  29.59 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  21.79 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2960  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>