More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0492 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  669    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  63.72 
 
 		 334 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  63.72 
 
 		 334 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  61.98 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  55.96 
 
 		 331 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  36.42 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 320 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 332 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 377 aa  89  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  26.43 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  36.03 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  38.61 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  27.27 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  32.14 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  30.07 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  34.86 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.93 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  35.29 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  34.56 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6337  transcriptional regulator, AraC family  43.02 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0658  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  35.17 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  27.5 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4321  helix-turn-helix domain-containing protein  21.15 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  43.9 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  37.37 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  43.9 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  22.74 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  43.9 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  29.76 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2517  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.9 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1419  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00505932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.18 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3031  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000013989  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  31.34 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  24.08 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 773 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  24.65 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2168  transcriptional regulator, AraC family  28.47 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>