More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1611 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  39.24 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  34.36 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  38.78 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  31.84 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.85 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  25.97 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 332 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5371  transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  35.77 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 313 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  29.58 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  33.8 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  27.64 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  30 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  33.8 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  33.8 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  33.8 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  30.32 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.57 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  26.38 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  27.33 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  29.79 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  32.64 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  30.66 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  23.32 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  23.19 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3379  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.949377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  20 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  29.58 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  32.66 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0345  helix-turn-helix domain-containing protein  32.87 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1795  transcriptional regulator, AraC family  22.92 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0839  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0422  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0285  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000546061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  33.67 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  44.59 
 
 		 1373 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  28 
 
 		 1374 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3237  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>