More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0345 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0345  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 305 aa  643    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  25.35 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  31.1 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  24.26 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  23.35 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  22 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  29.37 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  31.68 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  28.47 
 
 		 1296 aa  63.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 519 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3436  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  26.11 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1904  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  33.01 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  30.63 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0864  two component AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 503 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  23.23 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  28.85 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 719 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  36.27 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2187  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 752 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.97772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  33.64 
 
 		 1343 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0179  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0264145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.98 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1706  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 778 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0404668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  34.26 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  27.94 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  23.18 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1140  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0654  HTH-type regulatory protein, AraC family  34.69 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3823  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  27.1 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  27.47 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 548 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>