More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1904 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1904  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4273  transcriptional regulator, AraC family  78.95 
 
 		 119 aa  175  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.673244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4307  transcriptional regulator, AraC family  62.73 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 273 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 548 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  31 
 
 		 537 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  30 
 
 		 530 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 427 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2642  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2987  transcriptional regulator fragment  32.99 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2914  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  32.99 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.431589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  30.85 
 
 		 287 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  29.31 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  26.53 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  29.31 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  35.05 
 
 		 1306 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  29.31 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  29.31 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  29.31 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 330 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1830  Fis family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 348 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.733029  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 382 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 		 519 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 313 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 313 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  38.79 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3221  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 313 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0345  helix-turn-helix domain-containing protein  34.07 
 
 		 305 aa  63.5  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  41.9 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 343 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 513 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 310 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02292  predicted DNA-binding protein  31.53 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3614  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.950607 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1275  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2519  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 331 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02253  hypothetical protein  31.53 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2534  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1287  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2672  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 364 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  36.05 
 
 		 1316 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 532 aa  60.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 533 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0876  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 405 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 344 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 234 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 331 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39 
 
 		 259 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  36.9 
 
 		 1327 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 285 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 265 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 532 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 347 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 368 aa  60.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2751  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1294  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0435473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  31.93 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  25.23 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 414 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  28.43 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 539 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  29.81 
 
 		 1340 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 338 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>