More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5340 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  96.88 
 
 		 352 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 373 aa  751    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  85.01 
 
 		 364 aa  620  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  84.81 
 
 		 343 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  84.1 
 
 		 343 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 343 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  41.42 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.48 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  36.2 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 342 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  34.99 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 340 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 340 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 340 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 340 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 340 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  35.49 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3648  transcriptional regulator, AraC family protein  34.13 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  32.19 
 
 		 330 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 356 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  29.74 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  29.34 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 382 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  32.25 
 
 		 339 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  31.45 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 360 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  27.49 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.23 
 
 		 343 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1968  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5769  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0121  putative transcriptional regulator  28.39 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0425295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3221  transcriptional regulator, putative  27.85 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  27.83 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  28.82 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>