More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0976 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 341 aa  709    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  73.67 
 
 		 364 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  70.12 
 
 		 345 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  64.12 
 
 		 341 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  58.13 
 
 		 345 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 366 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 366 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 366 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 369 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 369 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 369 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  30.46 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  32.4 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  29.26 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  32.09 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 344 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  32.75 
 
 		 354 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 347 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.23 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 338 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 		 339 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 364 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 345 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 357 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 343 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  25.15 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0121  putative transcriptional regulator  27.73 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0425295  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  29.19 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0082  hypothetical protein  27.38 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00626494  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 341 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  24.86 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  28.34 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3648  transcriptional regulator, AraC family protein  31.55 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  27.44 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  25.45 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3221  transcriptional regulator, putative  25.86 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1113  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 339 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  28.13 
 
 		 352 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>