More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2784 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
398 aa  795    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  87.53 
 
 
370 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  88.53 
 
 
340 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  88.53 
 
 
340 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  88.53 
 
 
340 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  88.53 
 
 
340 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  88.24 
 
 
340 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  88.24 
 
 
340 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  44.11 
 
 
344 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 
342 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  41.84 
 
 
321 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  39.04 
 
 
360 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 
338 aa  224  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  42.9 
 
 
350 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 
352 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  37.57 
 
 
343 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
373 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 
343 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 
343 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  36.04 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 
351 aa  186  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3648  transcriptional regulator, AraC family protein  33.83 
 
 
333 aa  180  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 
339 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 
382 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 
359 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 
330 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 
332 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 
330 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 
366 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
366 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 
341 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
345 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 
372 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 
343 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
330 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 
347 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 
336 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 
336 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 
366 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
369 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
369 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 
347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 
356 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 
330 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 
345 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
345 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  30.27 
 
 
339 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  29.48 
 
 
345 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0132  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  28.7 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.968788  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 
357 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 
339 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  29.17 
 
 
339 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 
345 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0121  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0425295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  27.5 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
356 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 
355 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3221  transcriptional regulator, putative  25.85 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  27.67 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 
356 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0082  hypothetical protein  29.18 
 
 
338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00626494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 
336 aa  127  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 
360 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  29.71 
 
 
339 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 
364 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 
336 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
360 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  25.78 
 
 
335 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 
385 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 
356 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 
335 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 
339 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0191  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  25.47 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2578  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2722  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 
341 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  33.09 
 
 
330 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  32.82 
 
 
347 aa  119  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4356  AraC family transcriptional regulator  32.15 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>