More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5360 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
366 aa  736    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  80.6 
 
 
366 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  80.87 
 
 
366 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  79.45 
 
 
366 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  79.35 
 
 
369 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  79.35 
 
 
369 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  79.08 
 
 
369 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  72.25 
 
 
372 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  43.6 
 
 
345 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  43.58 
 
 
345 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  44.61 
 
 
364 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  38.99 
 
 
341 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  34.26 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
356 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  31.85 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
330 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
382 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  33.64 
 
 
339 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 
330 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.43 
 
 
321 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 
385 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 
343 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 
340 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 
344 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 
389 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 
389 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 
364 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 
343 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  30.79 
 
 
359 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
425 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 
343 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.75 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 
344 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
373 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  31.97 
 
 
339 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 
350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 
337 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 
336 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  28.49 
 
 
344 aa  126  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 
347 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 
336 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 
336 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  29.34 
 
 
354 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
355 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
357 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  32.54 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 
347 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  31.06 
 
 
357 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  27.79 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  24.7 
 
 
335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  30.07 
 
 
288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 
342 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 
352 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 
345 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 
366 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
340 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  24.7 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 
345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 
348 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  28.88 
 
 
337 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
370 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3648  transcriptional regulator, AraC family protein  27.46 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
350 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>