More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2577 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 344 aa  713    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  27.95 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 372 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 366 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  26.28 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  25.84 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 339 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  29.11 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 339 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  25.44 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  25.68 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 343 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  26.24 
 
 		 339 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  26.2 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  25 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3046  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 338 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  25.3 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1519  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0248055  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  24.68 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  24.29 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  23.25 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  24.77 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  24.7 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  23.88 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 347 aa  99.4  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  23.56 
 
 		 358 aa  99.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 357 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  22.67 
 
 		 327 aa  99.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  23.22 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  23.03 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.09 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 385 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0469  helix-turn-helix domain-containing protein  27 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 337 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 353 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  25.09 
 
 		 335 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  23.05 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>