More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37400 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 344 aa  678    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 360 aa  322  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 342 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 398 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 338 aa  265  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  44.55 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  47.13 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 340 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  42.4 
 
 		 351 aa  222  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 339 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3648  transcriptional regulator, AraC family protein  39.04 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 345 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 366 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 366 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  38.56 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  37.27 
 
 		 339 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 369 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  38.49 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  36.84 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 364 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  31.89 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 389 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 356 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  33.56 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 389 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 385 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 389 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 425 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 345 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  30.46 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 		 347 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  26.73 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  26.58 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0191  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211144  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2578  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2722  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4356  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  30.11 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  31.17 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>