More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1690 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
341 aa  708    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  64.12 
 
 
341 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  62.24 
 
 
345 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  59.23 
 
 
364 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  44.88 
 
 
345 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  41.19 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 
366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
369 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
369 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
366 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
369 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  39.7 
 
 
372 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  38.99 
 
 
366 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  32.42 
 
 
354 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
382 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
340 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 
344 aa  155  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 
345 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  31.78 
 
 
339 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  31.78 
 
 
339 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 
347 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
336 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
336 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 
345 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 
364 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 
343 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 
352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.61 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 
345 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 
345 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  30.62 
 
 
359 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 
332 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
330 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
343 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 
345 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
336 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 
347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 
373 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 
339 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 
344 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.45 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
330 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 
330 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
356 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  28.13 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
338 aa  133  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 
342 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 
343 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2159  helix-turn-helix domain-containing protein  29.05 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 
339 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
389 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
389 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 
398 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  29.62 
 
 
344 aa  125  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 
389 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 
345 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0121  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 
334 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0425295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 
339 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
337 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
330 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 
345 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
425 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  26.82 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  28.23 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0082  hypothetical protein  25.91 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00626494  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 
385 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 
366 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0191  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 
350 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211144  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 
350 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 
350 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 
350 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2578  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 
350 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 
350 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2722  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 
350 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  27.94 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 
353 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3221  transcriptional regulator, putative  25.37 
 
 
339 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 
353 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
337 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 
343 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  26.22 
 
 
396 aa  116  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  31.06 
 
 
347 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3648  transcriptional regulator, AraC family protein  30.82 
 
 
333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>