More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1336 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 336 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  99.7 
 
 		 347 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  95.82 
 
 		 347 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 336 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  79.94 
 
 		 345 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  80.24 
 
 		 345 aa  547  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  79.94 
 
 		 345 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  79.94 
 
 		 345 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  79.34 
 
 		 345 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  78.95 
 
 		 247 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 357 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2722  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0191  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211144  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2578  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 356 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 355 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 360 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  33.33 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  33.53 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 357 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 398 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  30.4 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  31.41 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 344 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  28.94 
 
 		 359 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 364 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 340 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  27.81 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  27.81 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  29.67 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 369 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 369 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  30.1 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1113  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 356 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  29.14 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1968  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 366 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 343 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  26.81 
 
 		 356 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 366 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  26.81 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 364 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2159  helix-turn-helix domain-containing protein  24.77 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>