More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1997 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  98.81 
 
 
335 aa  690    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  695    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  30.54 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  31.92 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 
336 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 
339 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  30.91 
 
 
339 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
330 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  27.35 
 
 
347 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 
340 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  26.96 
 
 
368 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 
347 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 
360 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 
330 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0191  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
350 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211144  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
350 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
350 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2578  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
350 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2722  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
350 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 
345 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
350 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
350 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  26.63 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  28.97 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 
355 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 
353 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  26.6 
 
 
357 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
345 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
345 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 
382 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
337 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
332 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  26.06 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 
288 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5769  putative transcriptional regulator  26.69 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  23.21 
 
 
344 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 
360 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.2 
 
 
343 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  25.81 
 
 
346 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 
343 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 
398 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1113  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 
339 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  26.88 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  26.61 
 
 
348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  25.08 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 
353 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  24.92 
 
 
353 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 
347 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  23.3 
 
 
359 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 
353 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1968  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 
348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  26.6 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
361 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 
344 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 
359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 
364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 
346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  23.72 
 
 
344 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 
366 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  24.56 
 
 
357 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 
341 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  23.05 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
366 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  23.95 
 
 
346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  23.25 
 
 
360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>