More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4573 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  690    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 344 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 398 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  41.59 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  39.57 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 373 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 340 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 364 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  38.35 
 
 		 351 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  29.58 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3648  transcriptional regulator, AraC family protein  31.5 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  29.45 
 
 		 345 aa  136  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 347 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  30.72 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  30.07 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  31.72 
 
 		 339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 425 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  31.39 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  29.1 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  26.77 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.86 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  26.46 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  30.21 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 385 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1968  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 		 368 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 353 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  28.76 
 
 		 346 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>