More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2068 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
339 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  81.45 
 
 
345 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 
352 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
373 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  45.4 
 
 
343 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  41.52 
 
 
343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 
351 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 
360 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.23 
 
 
321 aa  165  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 
398 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 
350 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 
338 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 
342 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3648  transcriptional regulator, AraC family protein  31.83 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  30.4 
 
 
344 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
340 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
340 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
340 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
340 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 
370 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 
340 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
340 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 
347 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
336 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 
372 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
336 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 
369 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  32.83 
 
 
345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
366 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
366 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
345 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
345 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
366 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 
330 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
369 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
369 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 
345 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
345 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  27.99 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5769  putative transcriptional regulator  33.44 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1968  AraC family transcriptional regulator  31.77 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 
341 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
330 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  30.61 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  29.49 
 
 
347 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  29.28 
 
 
356 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.17 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  29.55 
 
 
345 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  28.13 
 
 
396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  29.51 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
382 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  25.58 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  26.28 
 
 
335 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 
343 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  25.31 
 
 
345 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 
345 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
336 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 
348 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  28.25 
 
 
341 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 
340 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
332 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  26.92 
 
 
346 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  28.61 
 
 
339 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
382 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0132  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  26.15 
 
 
337 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.968788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 
345 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  28.61 
 
 
339 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 
247 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 
353 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 
343 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 
360 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  28.87 
 
 
348 aa  99.4  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  29.71 
 
 
335 aa  99.4  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 
357 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30620  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0924433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 
353 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  28.48 
 
 
353 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0082  hypothetical protein  26.05 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00626494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>