More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2587 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  696    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 343 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0593  putative transcriptional regulator  34.64 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  28.13 
 
 		 341 aa  145  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  31.55 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  29.61 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 348 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  25.62 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 353 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  26.41 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 353 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  30.03 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  24.69 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 		 337 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 366 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4913  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  30.18 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6030  AraC family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 342 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  26.9 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  26.55 
 
 		 348 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 372 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  25.55 
 
 		 346 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 398 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 347 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 339 aa  115  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3046  transcriptional regulator, AraC family  28.39 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  25.37 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3659  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 417 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  0.158074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 376 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.8 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 366 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0743  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  26.43 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  27.79 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1446  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  26.4 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  28.48 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 330 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 330 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2071  helix-turn-helix domain-containing protein  24.11 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 338 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4068  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5125  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.506358  normal  0.385561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  26.33 
 
 		 365 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0399  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 198 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  26.98 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3765  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>