More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0132 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0132  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  100 
 
 		 337 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.968788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0082  hypothetical protein  45.99 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00626494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0121  putative transcriptional regulator  44.14 
 
 		 334 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0425295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3221  transcriptional regulator, putative  43.83 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0094  regulatory protein  46.8 
 
 		 211 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 364 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 389 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 389 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 385 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 332 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 330 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  30.96 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 356 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  28.53 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  24.77 
 
 		 345 aa  99.4  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 364 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 344 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  26.2 
 
 		 327 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3765  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  26.97 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3046  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  25.5 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 353 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  28.04 
 
 		 353 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  24.34 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  24.35 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  24.77 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 		 338 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7688  transcriptional regulatory protein  29.2 
 
 		 338 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  26.03 
 
 		 396 aa  86.3  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 364 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4725  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0747  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  24.85 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5976  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  24.93 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 351 aa  82.4  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>