More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2942 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 359 aa  751    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  83.75 
 
 		 360 aa  633  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  40.95 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 345 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  39.72 
 
 		 346 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  39.72 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 346 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  28.61 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 333 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  26.63 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  26.35 
 
 		 339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  24.28 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0593  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 348 aa  119  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  25.21 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  25.85 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  26.33 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  28.06 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  26.65 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 353 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  25.65 
 
 		 353 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 358 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 343 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  30.39 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  23.61 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 198 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  23.61 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  22.65 
 
 		 341 aa  106  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2718  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309791  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  24.93 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1230  AraC family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.593917  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  25.15 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  26.04 
 
 		 343 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  31.09 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  25.63 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 366 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  26.07 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  27.4 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  31.79 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  23.65 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  22.97 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  23.85 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 360 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 400 aa  99.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3972  transcriptional regulator, AraC family  29.95 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>