More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1230 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1230  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 350 aa  727    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.593917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4268  AraC family transcriptional regulator  59.82 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  57.01 
 
 		 345 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 337 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 344 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 353 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  29.7 
 
 		 353 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  29.57 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  29.97 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 341 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  29.11 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2560  AraC family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  25.52 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3485  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2808  transcriptional regulator, AraC family  27.46 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5980  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 		 357 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  27.74 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  23.74 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  26.77 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  26.93 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  26.07 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  24.68 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  24.74 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  27.25 
 
 		 347 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 343 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 346 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  23.64 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1446  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0743  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  30.26 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  23.64 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4290  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  23.91 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  25.8 
 
 		 348 aa  93.2  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 338 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  26.09 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 389 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  24.35 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  25.55 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  24.2 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 361 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  23.46 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 356 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 389 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 389 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  24.43 
 
 		 343 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  25.38 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0593  putative transcriptional regulator  25.34 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>