More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0324 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  100 
 
 		 330 aa  672    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  84.85 
 
 		 330 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  60.36 
 
 		 334 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 337 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 353 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  34.44 
 
 		 353 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  31.35 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1230  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.593917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4268  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 367 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  26.75 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  28.66 
 
 		 348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 342 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  26.59 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 343 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  28 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  27.41 
 
 		 338 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  24.57 
 
 		 360 aa  105  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0593  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  25.15 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  25.15 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.98 
 
 		 343 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 357 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  27.38 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  26.77 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  29.22 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4290  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 359 aa  99.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 346 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  25.38 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  27 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 366 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 369 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2560  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 369 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 339 aa  96.3  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 369 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  25.71 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  35.75 
 
 		 198 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31480  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.263324  hitchhiker  0.0000037216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  24.84 
 
 		 366 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  23.03 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 341 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5546  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 373 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1446  transcriptional regulator, AraC family  24.6 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>