More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1606 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 358 aa  727    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  82.85 
 
 		 347 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  77.91 
 
 		 337 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  44.67 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  44.67 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  45.43 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 345 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 375 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 339 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  42.81 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 335 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 360 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  38.46 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 353 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  31.83 
 
 		 353 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  31.12 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  30.03 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 335 aa  133  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 335 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  28.87 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 334 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  28.84 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  29.75 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 353 aa  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  25.76 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1176  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 390 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 332 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2508  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  25.94 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  25 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  23.68 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  29.12 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  24.55 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  26.15 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1446  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 344 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  25.16 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  24.13 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 341 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  27.69 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  25.62 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  26.67 
 
 		 346 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 343 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 346 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  24.24 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>