More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2149 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 365 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  78.84 
 
 		 375 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  57.86 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  58.31 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  55.52 
 
 		 335 aa  362  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  49.85 
 
 		 366 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 333 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 340 aa  278  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 335 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  44.62 
 
 		 358 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  44.62 
 
 		 358 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 358 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 347 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 351 aa  242  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  38.6 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 363 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  30.12 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 353 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 353 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  29.72 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 347 aa  133  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 359 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  30.38 
 
 		 348 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 332 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 335 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 351 aa  122  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  27.27 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  28.34 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  28.34 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 341 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 339 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  29.62 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  32.44 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  31.75 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  28.92 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0267  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.128312  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 348 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  26.86 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  24.92 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.61 
 
 		 345 aa  103  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  24.23 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  24.56 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 343 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  28.01 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  23.96 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  27.44 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5495  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 309 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143439  normal  0.457572 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 343 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000628  putative transcription regulator  28.48 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 357 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  26.53 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>