More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1356 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 350 aa  692    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  35.4 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  32.84 
 
 		 330 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 330 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  28.53 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  34.18 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  32.44 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  29.62 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0469  helix-turn-helix domain-containing protein  34.73 
 
 		 353 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 353 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0743  AraC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  31.02 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3765  AraC family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 361 aa  99.4  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  31.74 
 
 		 356 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  31.44 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  29.15 
 
 		 390 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3219  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4941  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  30.72 
 
 		 339 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 343 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  28.12 
 
 		 343 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  31.19 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3046  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 347 aa  93.2  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 367 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 341 aa  92.8  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3834  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  30.35 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3459  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 336 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195796  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 358 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4068  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 344 aa  89.7  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6507  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 344 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739448  normal  0.944873 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  28.68 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3527  helix-turn-helix domain-containing protein  29.39 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1446  transcriptional regulator, AraC family  28.73 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  30.8 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 344 aa  87.4  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>