More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5344 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  87.99 
 
 		 339 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  87.72 
 
 		 334 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  87.13 
 
 		 334 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  86.23 
 
 		 334 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  86.23 
 
 		 334 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  85.93 
 
 		 334 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  76 
 
 		 338 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  64.81 
 
 		 327 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  62.96 
 
 		 330 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  60.42 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2910  helix-turn-helix domain-containing protein  64.92 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.659583  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5098  helix-turn-helix domain-containing protein  58.79 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  58.97 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4381  transcriptional regulator, AraC family  57.01 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6507  transcriptional regulator, AraC family  58.82 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739448  normal  0.944873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  57.06 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5125  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 353 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.506358  normal  0.385561 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4085  transcriptional regulator, AraC family  42.15 
 
 		 338 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  0.45247 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3972  transcriptional regulator, AraC family  42.15 
 
 		 338 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184414  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05569  transcription regulator protein  44.51 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6030  AraC family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31480  AraC family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.263324  hitchhiker  0.0000037216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4913  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 338 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4905  AraC family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.205167 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4386  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.282162  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  42.15 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0713  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5322  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0019262  decreased coverage  0.00625276 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4964  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.075656  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1083  AraC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 356 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148989 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3403  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2680  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 353 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0847825  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  40.87 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0902  AraC family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 358 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2177  AraC family transcription regulator  44.44 
 
 		 375 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0917  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 375 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323818  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0825  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 375 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3655  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2211  AraC family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3527  helix-turn-helix domain-containing protein  41.32 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1804  AraC family transcription regulator  42.9 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  42.64 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1836  AraC family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3459  AraC family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195796  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3753  AraC family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2010  helix-turn-helix domain-containing protein  41.25 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2150  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.511846  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2197  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.536448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2071  helix-turn-helix domain-containing protein  36.25 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3659  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  0.158074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4256  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.933319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  37.99 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  36.53 
 
 		 333 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3372  transcriptional regulator, AraC family  39.63 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 335 aa  192  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6273  AraC family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294899  normal  0.494705 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6762  AraC family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1556  AraC family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728217  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 348 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6814  AraC family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 352 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  34.24 
 
 		 338 aa  186  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5444  AraC family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5781  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.436402 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5546  AraC family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0242  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3935  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2141  AraC family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2718  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0400  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1917  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0381  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  32.53 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  34.86 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2633  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2365  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370263  hitchhiker  0.0000237936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3351  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  normal  0.830085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0469  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2050  AraC family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105826  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3765  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3834  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7688  transcriptional regulatory protein  32.72 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4164  AraC family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0747  transcriptional regulator, AraC family  32.83 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40849  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2601  putative transcriptional regulator  30.45 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0251856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3046  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5513  putative AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 348 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4356  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>