More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3219 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3219  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 364 aa  746    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4941  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 364 aa  746    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4068  transcriptional regulator, AraC family  73.5 
 
 		 355 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4290  AraC family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6523  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317039 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6033  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.695454 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5669  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1252  transcriptional regulator, AraC family  45.23 
 
 		 336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05257  hypothetical protein  41.62 
 
 		 332 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2480  transcriptional regulator, AraC family  43.43 
 
 		 336 aa  259  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  29.19 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 337 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  30.69 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 353 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 342 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 343 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  31.43 
 
 		 365 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 198 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  30.32 
 
 		 350 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  28.53 
 
 		 327 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  26.14 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1917  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 343 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  28.31 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  28.91 
 
 		 335 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 346 aa  89.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  34.19 
 
 		 335 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 334 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  27.52 
 
 		 339 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4256  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.933319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  41.59 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 349 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  41.59 
 
 		 366 aa  87  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  29.53 
 
 		 339 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 342 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  40 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3372  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  31.67 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  31.87 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  33.74 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  31.61 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5098  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 327 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>