More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2142 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  78.51 
 
 		 340 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  67.73 
 
 		 345 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  50.76 
 
 		 358 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  50.76 
 
 		 358 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  49.09 
 
 		 352 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 358 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  42.38 
 
 		 343 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 365 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 375 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  36.58 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  29.15 
 
 		 340 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 352 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 353 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 350 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  27.86 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  26.77 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5495  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143439  normal  0.457572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  27.22 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 339 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  25.96 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  27.76 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  26.86 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  27.61 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1176  AraC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  24.71 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  24.3 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3048  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.428431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  25.16 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  22.71 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  25.15 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  27.7 
 
 		 362 aa  95.9  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  22.19 
 
 		 362 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000628  putative transcription regulator  23.56 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 348 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 351 aa  95.9  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  23.2 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  24.58 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  23.25 
 
 		 341 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  24.76 
 
 		 360 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2560  AraC family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  23.08 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  25.25 
 
 		 359 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  24.76 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  21.4 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  21.4 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  25.08 
 
 		 366 aa  87  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 366 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  24.69 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>